尤其是遇上没什么军事素养又喜欢干预军务的皇帝和臣，有时，甚至以没有军事经验的臣和士家子弟领军打仗，这仗就没办法打了！
经过此次调整，兵部成为处理日常事务、人事、后勤的机构，没有对军队的直接管理权；设元帅府，高级将领平时在元帅府任职，管理军队的训练和调动，方便将领熟悉各支部队的特点，战时元帅府节制诸军、统全国军事战略指挥，但不得干涉政务；枢密院最终成了专门的参谋机构，负责平时的情报、战事的建议，对军事指挥有制衡之权。
调兵权还掌握在皇帝的手，旦指派了高级将领担任战场的指挥官，同样派出谋士团作为协助，战场指挥权从此下放到负责指挥的将领手，不再由皇帝干预。
宰相和枢官员平时可以通过兵部任命、罢免将领、各级军事官员，制定军事法规来调整军务，但不能干涉具体的军事指挥，彻底取消了官对战事进程的干预。
在宋朝原来已经制定的《赏罚格条》基础上，再由朝廷制定全面的军法，保证军队训练和后勤，以打造支既忠于国家，又可以决胜疆场的军队。